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一种基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析细胞外泌体通讯的方法

单位名称 北京恩泽康泰生物科技有限公司 大赛年份 2023年
大赛届次 第18届 奖项 银奖
发明人姓名 林海军,张娟,李志,时韦美,刘翔
技术领域 生物医药,
应用行业 外泌体研究与应用,生物信息
项目类别 专利,计算机软件著作权
专利类型 发明
专利情况 申请号 申请日期
专利号 授权日期
计算机软件著作权证书登记号
项目简介 1. 发明目的、基本思路、与现有技术对比有什么改进与创新
外泌体是由细胞分泌的包含复杂遗传信息和蛋白质的囊泡,其可以通过多种方式由外泌体供体细胞产生,被外泌体受体细胞接受,进而进行细胞间信号的传导。本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析细胞外泌体通讯的方法。所述方法包括:获取待测样品的单细胞转录组数据和外泌体组学数据;根据单细胞转录组数据判断存在外泌体通讯的细胞亚群;进一步结合外泌体组学数据进行细胞外泌体通讯分析;外泌体组学数据包括如下中的至少一种:外泌体的miRNA组学数据、外泌体的mRNA组学数据、外泌体的lncRNA组学数据或外泌体的蛋白组学数据。本发明基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析可能存在外泌体通讯的细胞亚群以及相应的通讯信息,可以准确、全面、多方位地推测组织内不同细胞亚群间的外泌体通讯情况,对于外泌体通讯的相关研究具有重要意义。
2. 已取得的社会及经济效益,如:产值、利润、节约能源及改善环境等方面
现有技术中存在对细胞外泌体通讯相关的研究,例如有研究从肿瘤细胞的单细胞测序数据,推测肿瘤细胞和少突胶质细胞间可能存在外泌体通讯;有研究从组织外泌体数据中确定关键蛋白质,之后结合单细胞数据推测该外泌体的来源细胞;有研究通过单细胞测序发现肿瘤细胞和成纤维细胞间存在配受体通讯,进而通过体外实验确定了这两者间还存在外泌体通讯,但是这些方法存在有分析方法简单,结果单一的问题,难以全面地分析微环境中不同细胞亚群间的外泌体通讯信息。为了解决现有技术存在的技术问题,本发明提供一种检测细胞外囊泡通讯的方法。本发明提出了一种基于单细胞转录组与组织外泌体多组学数据分析细胞亚群间的外泌体通讯信息的完整方案,可以更加准确、全面地分析组织间的细胞通讯情况。本发明提供的方法非常适用于同一个样本匹配的单细胞转录组数据和外泌体组学数据联合分析,但不限于同一个样本,单细胞数据和外泌体数据来源组织类型匹配即可。
项目进展阶段 批量生产和应用
备注 本项创新性技术,已获批国内发明专利及软件著作权,相关产品荣获北京市新技术新产品认定,基于本技术,企业也取得了良好的经济效益。